거너는 걍 상위 레이더가 아니라 가입 가능한 팩션으로 변화, 미닛맨과 적대적 세력이라 미닛맨 가입시 가입불가, 나중에는 브라더후드와 적대적이 되며 최종적으로 브라더후드, 다이어몬드 시티를 무너뜨리고 커먼웰스 최대 무력세력이 되는게 목표

레이더는 뭉텅이로 레이더로 불리는게 아니라 각자 갱단의 이름으로 불림

컴뱃존, 이지시티 같은 경기장이 그냥 레이더 던전이 아니라 플레이어가 참여 가능한 소도시로 변화

 미닛맨 메인퀘는 걍 랜덤 정작치 건설이 아니라 거너와 여러 레이더 갱단에게 빼앗긴 미닛맨 영토 탈환으로 바뀜, 최종적으로 퀸시 전투로 마무리

레일로드는 주 구성원이 탈출한 신스인걸로 변화, 소수의 인간만 신스에 동조하여 돕는다는 설정으로 변경, 파하버의 아카디아같은 세력으로 변화

누카월드 메인퀘는 레이더가 아니라 시에라와 함께 누카월드를 탐험하며 누카콜라 ceo의 비밀을 파해치는걸로 변경, 서브퀘로 누카월드 레이더갱, 상인연합 팩션 퀘스트가 있음, 최종적으로 누카월드 ceo가 있는 비밀 볼트에서 누가 누카월드를 운영할지 결정함